著作：

《东北史纲》，中央研究院历史语言研究所1932年出版。 

《性命古训辨证》，中央研究院历史语言研究所1936年出版。 

《傅孟真先生集》，台湾大学出版社1952年版。 

《傅斯年选集》，文星书店1967年出版。 

《傅斯年全集》，台湾联经出版事业公司1980年版。 

论文： 

《中国学术界之基本谬误》，《新青年》第4卷第4号，1918 年4月。 

《〈新潮〉发刊旨趣书》，《新潮》第1卷第1号，1919年1月。 

《论孔子学说所以适应于秦汉以来的社会之缘故》，《中山大学语言历史研究所周刊》第1集第6期，1927年11月。 

《历史语言研究所工作之旨趣》，《中央研究院历史研究所集刊》第1本第1分，1928年10月。 

《大东小东说》，《中央研究院历史语言研究所集刊》第2本第1分，1930年5月。 

《考古学的新方法》，《史学》第1期，1930年12月。 

《夷夏东西说》，《中央研究院历史语言研究所集刊》外编第1 种《庆祝蔡元培先生六十五岁论文集》，1933年1月。 

《周东封与殷遗民》，《中央研究院历史语言研究所集刊》第4 本第3分，1934年6月。 

《〈史料与史学〉发刊词》，《中央研究院历史语言研究所集刊》外编第2种《史料与史学》，1945年11月。