國家清史編纂委員會項目中心成立於2003年5月29日，是國家清史編纂委員會直接領導下的常設工作機構，其工作定位和目標是通過規範化、程式化、網路化等現代科學管理手段和方式，貫徹落實清史編纂委員會的決議和指令，全面協調和組織管理清史編纂工程的所有立項專案，圓滿完成清史纂修工程。工作任務主要包括專案立項、經費管理、檢查評估、成果鑒定等。  

近期項目中心的主要工作是配合目前清史工程進展的需要，制定科學嚴密的清史纂修工程項目管理辦法和專案經費管理辦法。  

專案中心現任負責人為徐兆仁、劉為。